应用场景：单克隆抗体药物辅助筛选；致xingbing毒整合位点检测与整合偏好性分析等；WGS不适用于转染之后未经过传代培养和表型筛选的细胞系。丰富的项目经验目前，唯可已与国内外多家免疫zhiliao研究前沿企业开展合作，采用该方法对高度异质性的CAR-T细胞进行整合位点检测与细胞安全性评估，具有较为丰富的项目经验。一般HBV插入到基因组中形成下图结构。使用三代测序，靶向插入区域的测序reads可分为Readsgroup1（HBV插入区域测通）和Readsgroup2（reads部分比对染色体，部分比对HBV插入区域）。基于三代数据比对后bam文件的IGV图，判断变异类型，推断断点类型和插入序列。在靶向CD19的CAR-T临床试验中,慢病毒传染的CAR-T整合位点显示出更的抗效力。南通ISA整合位点实验室

基因编辑产品建议观察15年或至数据表明不再存在任何风险。?腺相关病毒载体建议观察5年或至数据表明不再存在任何风险。以上长期随访时间的建议主要基于基因zhiliao的产品类型，具体产品的随访时间取决于产品的特性和体内存在时间、转基因表达时间、迟发性不良反应的预期时间及发生率、受试者适应症和预期生存期、给药途径、以及长期随访的其他观察目的。随着随访数据的积累，研究者和研究申办方可能会根据产品的存在情况、转基因表达和临床表现的持续评估情况，延长或缩短长期随访的持续时间。如果研究申办方认为其基因zhiliao产品安全性风险较低、无需开展长期随访临床研究，或者希望变更随访时间，应合理说明依据或变更理由并与药品监督管理部门进行沟通。南通ISA整合位点实验室慢病毒载体在人角质形成细胞基因组中的整合位点分析。

相较于LM-PCR方法，重组细胞全基因组重测序需要较大数据量，比较适合用于经过表型筛选的单克隆细胞的测序，比如用于抗体药物生产重组CHO细胞的位点检测，但全基因组测序可对宿主基因组自身的变异进行检测。应用场景：CAR-T细胞安全性检测（药物申报）；基因zhiliao研究中使用的病毒性载体的安全性检测等；1.LM-PCR不适合评估每个整合位点插入序列发生的变异，不适用于插入序列的拷贝数检测，拷贝数检测可以采用qPCR方法进行。2.INZR-WGS（WGS法）

例如，对于经过基因修饰的免疫细胞zhiliao产品如CAR-T，采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)和流式细胞术（Flowcytometry）进行PK分析，分别通过测定外源基因拷贝和CAR+细胞数量的变化，有助于互相验证检测方法的可靠性，可以更duomian的分析产品在体内的扩增和存活情况。对于大多数免疫细胞zhiliao产品，可以通过细胞和/或体液免疫应答分析药效学活性。有多个特异性靶点的zhiliao产品，应分析其对每个靶点的作用活性。如果细胞经体外基因修饰，在体内分泌特定蛋白、多肽或其它活性成分，或敲除了特定基因的表达，也需要进行针对性的药效学分析，如检测特定蛋白的活性、持续时间和变化情况等。通过分选CAR-T 细胞,对T细胞受体(TCR)β链库进行深度测序(TCR-seq)以及慢病毒载体整合位点(LVIS)分析。

免疫细胞zhiliao产品的风险水平与多种因素有关，如细胞来源和类型、体内活性和存活时间、是否有外源基因表达、基因表达使用的载体类型以及是否存在基因组整合等。针对不同风险水平的免疫细胞zhiliao产品，随访持续时间的建议如下：?对于没有外源基因表达、且体外操作不改变细胞存活时间及分化潜能的免疫细胞zhiliao产品，长期随访的持续时间不应短于细胞在体内的自然存活时间，建议对受试者进行1年或以上的随访。22?对于有外源基因表达、但不存在基因整合或基因重组风险，或载体的基因整合或重组风险较低的免疫细胞zhiliao产品，建议对受试者进行不少于5年的随访。?对于有外源基因表达、而且表达载体存在基因整合或有基因重组风险的免疫细胞zhiliao产品，建议对受试者观察不少于15年。整合位点相比γ-逆转录病毒更安全，成本更高。南通LV整合位点分析

整合位点分析,基因和细胞的安全指南。南通ISA整合位点实验室

慢病毒整合事件要素及检测方法要求：对于食药监局指导性文件和既往研究内容，我们不难发现对于慢病毒整合检测所谓整合事件至少包含三个要素：整合位置；整合方向；特定整合位置和整合方向的juedui克隆数目；因此检测在定性和定量性能方面都有要求，检测方法需要结合临床样本进行分析性能进行系统验证。慢病毒整合位点检测方法，目前检测慢病毒整合位点的主要平台为高深度测序（NGS)。而目前较为成熟已经应用于工业产品检测及临床研究的整合位点富集建库方法为机械片段化及依赖于接头的扩增子建库(LM-PCR,如INSPIIRED),已经应用于多个CART19临床项目的安全性评估及与CAR-T细胞增值相关的回顾yao效学分析。南通ISA整合位点实验室