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深圳脱靶检测评估标准

来源: 发布时间:2024-04-11

GUIDE-Seq脱靶评估技术的优势分析鼓润致力于基因组编辑工具脱靶的分析检测工作,为筛选、优化基因组编辑工具的保真性提供标准化的分析。我们脱靶分析具有如下优势:实用性强:能反映CRISPR在真核细胞中进行基因编辑的在靶与脱靶情况,以进行安全性和有效性评价;检测通量高:一次能检测多个样本的在靶与脱靶情况,并通过优化的标签设计,降低实际的测序reads数量;准确性高:绝大部分检测结果可被验证;灵敏度高:能够高效检测出低频脱靶位点,检测低至0.1%的脱靶突变;实验难度低:操作过程简单易行细胞适应性强。如何检测是否发生脱靶? 基因编辑的脱靶率检测一般有两种方法。深圳脱靶检测评估标准

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细胞经基因修饰后会改变其生物学特性,同时也会带来新的安全性风险,如基因编辑脱靶风险、载体插入突变风险、载体重组风险、表达的转基因产物的风险等。在制定非临床研究计划时,除参考《细胞zhilliao产品研究与评价技术指导原则》(试行)中的对细胞zhilliao产品的一般要求外,还应具体问题具体分析,基于产品特点和目前已有的科学认知,结合拟定适应症、患者人群、给药途径和给yaofang案等方面的考虑,科学合理的设计和实施非临床研究,充分表征产品的药理学、毒理学和药代动力学特征。在进行获益风险评估时,还应重点关注由非临床向临床过渡时非临床研究的局限性和风险预测的不确定性。连云港基因疗法脱靶检测安评预算允许的情况下,通过全基因组测序的方法进行全基因组序列的分析和比对更精细,如基于NGS的iGUIDE方法。

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自基因zhiliao出现之日起,安全性问题就随之产生了,并成为阻碍基因zhiliao研发的一大障碍,吴宁博士认为:“基因zhiliao产品的研发和上市,安全性会将是一个非常重要考量。如果一款产品它安全性有问题的话,在市场化道路上就会受到很大影响。尤其是基因zhiliao,目前处于起始阶段,一旦出现不良事件,很有可能对整个行业都会产生致命打击。具体说来,基因zhiliao的安全性问题主要涉及基因插入突变、脱靶、生物分布和持久性、潜伏再jihuo以及潜在免疫原性等。”

CRISPR/Cas系统是细菌和古细菌在不断进化的过程中产生的适应性免疫防御机制,它应用CRISPR RNA(crRNA)以碱基互补的形式引导相应的Cas蛋白识别入侵的外源基因组,并对其DNA进行剪切,用以保护自身的基因组免受外源核酸如噬菌体、病毒等的干扰和破坏。经过人为改造后,可在真核细胞中实现高度灵活且特异的基因组编辑,通过设计特异性向导RNA(Single guide RNA, sgRNA)序列与靶序列进行碱基配对,从而引导Cas蛋白结合到靶序列处,行使DNA切割功能,然后利用细胞的非同源性末端连接(Non-homologous end joining, NHEJ)或同源重组(Homologous recombination,HR)修复机制对断裂的DNA进行插入缺失(Indel)、修复(Repair)或替换(Replacement)。由于其相对于锌指核酸酶(ZFNs)和转录jihuo因子样效应物核酸酶(TALENs)技术更易于操作,而且更高效,因而被广运用于对基因组特定位点进行靶向编辑。针对已经获得的有切割能力的sgRNA,需要进一步明确其体内脱靶效应。

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由于设计的sgRNA会与非靶点DNA序列错配,引入非预期的基因突变,即脱靶效应(Off-targeteffects)。脱靶效应造成了研究中的许多不确定性,这无疑限制了该技术的应用。因此,研究者希望能开发有效的方法来检测脱靶效应。在目前主流的脱靶效应评估方法中,有一种方法为GUIDE-seq,其原理是利用一种短的双链寡聚核苷酸(dsODN)标记CRISPR/Cas诱导的脱靶断裂,然后对标签所在的基因组区域进行高通量测序,通过生物信息学分析从而确定脱靶位点。利用该技术可以在基因组范围内检测CRISPR脱靶效应,从而改变了以往先预测假定脱靶位点再检测的思路;与其他的评估方法相比,GUIDE-seq更精确、更灵敏。脱靶检测在揭示CRISPR/Cas9系统的脱靶机制以及进一步提高系统靶向性的研究中具有重要作用。台州off-target脱靶检测政策

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以上长期随访时间的建议主要基于基因zhiliao的产品类型,具体产品的随访时间取决于产品的特性和体内存在时间、转基因表达时间、迟发性不良反应的预期时间及发生率、受试者适应症和预期生存期、给药途径、以及长期随访的其他观察目的。随着随访数据的积累,研究者和研究申办方可能会根据产品的存在情况、转基因表达和临床表现的持续评估情况,延长或缩短长期随访的持续时间。如果研究申办方认为其基因zhiliao产品安全性风险较低、无需开展长期随访临床研究,或者希望变更随访时间,应合理说明依据或变更理由并与药品监督管理部门进行沟通。深圳脱靶检测评估标准

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