欧易酵母文库助力苹果花青素合成调控机制研究。近日,山东农业大学郝玉金、由春香教授为共同通讯作者,在ThePlantJournal(IF:6.141)期刊发表了题为“JasmonateinducesanthocyaninandproanthocyanidinbiosynthesisinapplebymediatingtheJAZ1-TRB1-MYB9complex”的研究论文,报道了茉莉酸通过介导JAZ1-TRB1-MYB9复合物诱导苹果中花青素和原花青素的生物合成。山东农业大学安建平博士为***作者,文章中酵母文库实验由欧易生物协助完成。酵母单杂交技术是在酵母双杂基础上发展而来的一种研究核酸。...
母文库实验由欧易生物完成。2021年3月16日,宁波大学陈剑平院士、孙宗涛研究员为共同通讯作者,在PNAS杂志(IF:9.412)在线发表了题为“AclassofindependentlyevolvedtranscriptionalrepressorsinplantRNAvirusesfacilitatesviralinfectionandvectorfeeding”的研究论文,深入报道了在不同植物RNA病毒中一种***存在的、通过劫持茉莉酸信号途径以协同促进病毒传播和介体昆虫摄食的新机制。植物病毒基因组通常*编码少数几个蛋白,它们必需依赖寄主植物才能完成自身的侵染和增殖。因此植物病毒往往通过...
酵母双杂交文库:本研究通过7个树龄的油松样品转录组测序,鉴定到一个与年龄信号***相关的基因模块,该模块包含33个转录因子,包括SOC1-like、DAL1等。油松和晚坐果白皮松突变体中的基因表达模式分析显示,PtMADS11与生殖能力之间存在紧密相关性。酵母双杂交显示,MADS11和DAL1直接相关作用以参与对年龄信号的调控。过表达PtMADS11、PDAL1可以部分挽救拟南芥中miR156过表达或spl突变导致的开花延迟缺陷。只有PtMADS11可以挽救ft突变体中的开花缺陷,表明它与PtDAL1在拟南芥开花调控网络中发挥了不同的作用。专业酵母文库构建和筛选公司进口试剂。广东什么是酵母文库...
酵母文库实验实验表明,MdTRB1 可以正向调节花青素和原花青素的累积。MdTRB1 与 MdMYB9 结合可以增强后者对下游基因的转录***活性。而 MdTRB1 与 MdJAZ1 的结合,可以干扰其与 MdMYB9 的互作,进而负向调控 MdTRB1 介导的对花青素和原花青素积累的促进作用。本研究表明,JAZ1-TRB1-MYB9 复合物可以动态调控 JA 介导的花青素和原花青素的积累。本研究为进一步研究 JA 对花青素和原花青素生物合成的调节提供了新见解。本研究鉴定了一个可以与 MdMYB9 相互作用的蛋白 MdTRB1。实验表明,MdTRB1 可以正向调节花青素和原花青素的累积。使用原...
本研究利用水稻转录因子文库筛选,绘制了水稻转录因子和菌根共生相关基因之间的调控网络。该网络受到保守的磷感应途径统一控制,以磷酸盐饥饿响应因子(PHR)为中心。PHRs 是菌根共生所必需的,通过 P1BS 顺式作用元件调控菌根共生相关基因表达。高磷条件下,SPX蛋白抑制 OsPHR2 介导的对菌根共生相关基因表达的调控,进而抑制菌根共生。过表达 OsPHR2 可以部分拮抗磷介导的对菌根共生的抑制作用。本研究发现,植物直接营养吸收和通过菌根共生的间接营养吸收,都受到相同的磷信号网络统一调控。本研究将有助于高效用磷植株的培育。欧易生物酵母平台,从公司成立伊始,伴随着公司和客户一路成长,栉风沐雨十多年...
酵母双杂交文库:本研究通过7个树龄的油松样品转录组测序,鉴定到一个与年龄信号***相关的基因模块,该模块包含33个转录因子,包括SOC1-like、DAL1等。油松和晚坐果白皮松突变体中的基因表达模式分析显示,PtMADS11与生殖能力之间存在紧密相关性。酵母双杂交显示,MADS11和DAL1直接相关作用以参与对年龄信号的调控。过表达PtMADS11、PDAL1可以部分挽救拟南芥中miR156过表达或spl突变导致的开花延迟缺陷。只有PtMADS11可以挽救ft突变体中的开花缺陷,表明它与PtDAL1在拟南芥开花调控网络中发挥了不同的作用。酵母三杂交酵母文库数据库。山西筛库酵母文库做什么通过酵...
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通过酵母双杂交进行筛选,结果显示 SWC6 可以在蓝光下与 CRY1 相互作用(图 A-C)。同样,酵母双杂交实验显示 CRY2 也可以在蓝光下与 SWC6 相互作用(图 D)。并通过 pull-down、split-LUC、semi-in vivo pull-down、Co-IP 实验(图 E-L)证实 CRY1、CRY2 与 SWC6 的结合是蓝光依赖性的。SWC6 是真核生物中已报道的 SWR1 复合物亚基,负责催化 H2A.Z 在染色质上的替换。已报道 SWR1 复合物中 SWC6 可以与 ARP6 亚基结合。Pull-down、split-LUC、semi-in vivo pull-...
酵母单杂交筛选技术:关于HIV想必大家都不陌生,***HIV病毒后潜伏周期长,且目前没有完全的***方法。为了彻底***HIV,不让其发病就要从2方面入手:要么消除潜伏***的细胞,要么防止潜伏原病毒的细胞被***。也就是需要抑制HIV病毒的转录。但是关于HIV在人细胞中的复制、转录和潜伏期调控的分子网络仍不完全确定,所以目前HIV仍不能被**。为了帮助解决这个问题,波士顿大学的研究者,使用酵母单杂交筛选技术,以HIV-1,HIV-2的LTR(启动子和增强子)为诱饵,筛选了人的转录因子文库(包含1086个人的转录因子),**终绘制了调节HIV-1和HIV-2的转录网络图谱,结果发表在2021年...
酵母文库:细菌鞭毛蛋白是一种重要的细菌毒力因子,可刺激动植物细胞中的分子免疫信号转导。脊椎动物识别鞭毛蛋白和建立有效免疫反应的详细机制已经被揭示;然而,无脊椎动物是否能够识别鞭毛蛋白仍未可知。2022年1月24日,山东大学王显伟团队在PLOSPATHOGENS(IF:6.823)上发表了题为“Shoc2regnizesbacterialflagellinandmediatesantibacterialErk/Statsignalinginaninvertebrate”的研究论文,揭示了MjShoc2可以与鞭毛蛋白FlaA互作,引发一系列炎症反应,促使对虾抵抗细菌***,为无脊椎动物对鞭毛蛋白的...
酵母双杂交(Y2H):植物转录因子(Plant transcripter factors, TFs)是调控植物生长发育和环境适应性的关键分子。虽然在一些数据库中,如RiceSRTFDB (Priya and Jain, 2013), Ricettissuetfdb (Chen et al.,PlnTFDB (Pérez-Rodríguez et al., 2009)和PlantTFDB (Jin et al., 2017),可以预测水稻转录因子功能。但通过具体实验研究,来直接证实转录因子对植物的调控作用仍然是必不可少的。酵母双杂交(Y2H)和酵母单杂交(Y1H)是被用于研究蛋白-蛋白以及蛋白-...
酵母文库:近日,上海市农业科学院作物育种栽培研究所储黄伟副研究员、曹黎明研究员为共同通讯作者,在Plant,Cell&Environment杂志(IF:7.228)在线发表了题为“Aconservedclathrin-coatedvesiclecomponent,OsSCYL2,regulatesplantinnateimmunityinrice”的研究论文,报道了水稻中一个被网格蛋白包被囊泡的一个重要组分OsSCYL2调控稻水先天免疫的分子机制。上海市农业科学院作物所硕士研究生姚瑶和周继华助理研究员为该论文的共同***作者。文章中酵母双杂交实验由欧易生物完成。酵母文库质粒使用指南酵母菌的介绍...
酵母双杂交筛选实验:为进一步了解LEA3蛋白在干旱胁迫下调控植物生长和增强抗旱性的分子机制,本研究以干旱胁迫条件下的棉花根茎叶为材料,构建了棉花干旱胁迫酵母文库。并以GhLEA3为诱饵,采用酵母双杂交筛选实验,从棉花酵母文库中筛选获得了GhLEA3互作蛋白,并对互作蛋白进行了GO和KEGG分析,发现其中的互作蛋白GhVDAC1主要参与钙信号通路和cGMP-PKG信号通路,互作蛋白Gh***A参与多种生物途径,如糖原生成和代谢途径。此外,GhVDAC1和Gh***A受干旱胁迫诱导表达***,且在GhLEA3敲除的棉株中表达量低于野生型棉株根据每个客户的研究目标和内容灵活定制研究方案。既能提供建库...
酵母文库实验由欧易生物完成。2021 年 3 月,山东农业大学郝玉金教授为通讯作者,在 Plant Physiology 杂志(IF: 6.902)在线发表了题为“Interaction of BTB-TAZ protein MdBT2 and DELLA protein MdRGL3a regulates nitrate-mediated plant growth”的研究论文,深入探讨了硝酸盐介导的苹果生长调控分子机制。氮素是植物生长发育所必须的营养物质之一,硝酸盐是植物根系吸收无机氮的主要形式。除了营养功能,硝酸盐还可以通过多种信号途径来调节植物生长和发育过程。赤霉素(gibberelli...
进行了酵母双杂交文库的筛选,结果显示钙依赖的种子特异性蛋白激酶SPK可以与OsNF-YB9相互作用,分段截取互作验证显示OsNF-YB9的N端是互作所必须的(图a-b),并通过双荧光分子互补实验、BiFC、体外GST-pulldown实验得以证实(图c-e)。亚细胞定位显示SPK主要在细胞质中表达,OsNF-YB9在细胞质和细胞核中都有表达,共表达SPK和OsNF-YB9***促进了OsNF-YB9的入核(图f),表明SPK和OsNF-YB9的相互作用可能促进了OsNF-YB9从细胞质向细胞核的运输。RT-PCR显示SPK在发育中的种子中高表达,在5DAF开始***,并在10-30DAF维持高...
酵母文库筛选:为了系统地揭示调控丛枝菌根共生的转录因子,研究者以51个水稻基因的启动子为诱饵,利用包含1570个水稻全长转录因子的文库进行了酵母单杂交筛选。这51个基因主要是已报道的参与或调节菌根共生的基因。文库筛选发现了一个由266个转录因子和47个启动子高度连接的网络,称之为"丛枝菌根共生酵母单杂交网络(YAM)"。平均每个启动子可以和4个转录因子互作。266个转录因子分属至少11个转录因子家族。72%(192个)的YAM转录因子在根中存在表达(FPKM>1)。与非定殖根相比,19个YAM转录因子在丛枝菌根***定殖的根中表达上调。合作文章上百篇,平均影响因子高达7.124 欧易生物酵母文...
小欧从2018年即开始关注酵母杂交与高通量测序相结合的技术发展,如2017年CaoGang老师等发表的RLL-Y2H技术,实现了文库筛文库可能,该技术通过对酵母双杂常用载体的改造,并结合高通量测序,可直接获得AD-BD互作蛋白对。所用方法相当巧妙,感兴趣的同学请点击《当酵母双杂交遇到高通量测序》。钮老师团队之前的研究已经鉴定了DAL1作为一种保守的针叶树年龄生物标记基因,在油松从营养生长到生殖生长的时相转变过程中起重要作用。为了进一步理解年龄效应如何驱动针叶树的发育,阐明与DAL1相关的蛋白互作网络很关键。钮老师团队利用传统的Y2H筛选技术结合NGS测序技术,优化得到了Y2H-seq技术,与传...
欧易酵母文库助力小麦根长抑制分子机制研究,近日,中国农业科学院作物科学研究所景蕊莲研究员、河南农业大学王翔副教授为共同通讯作者,在 Journal of Experimental Botany 杂志(IF: 6.992)在线发表了题为“Wheat SHORT ROOT LENGTH 1 gene TaSRL1 regulates root length in an auxin-dependent pathway”的研究论文,报道了小麦 TaSRL1 转录因子调控根长的分子机制。文章中酵母双杂交文库由欧易生物完成。根系是植物从土壤中吸收水分、养分和感知环境刺激的独特***。根系结构的优化有助于提...
单杂交筛选为了挖掘影响ALA诱导苹果黄酮醇积累的关键性调控因子,作者以Y1HGold[proMdFLS1-AbAi] 为诱饵,通过酵母单杂交筛选了ALA处理后的苹果愈伤组织cDNA文库。结果显示筛选出的蛋白质主要参与光合作用调控、碳糖代谢、氧化/渗透胁迫响应、***信号转导、木质素生物合成、果实成熟发育等过程,以及一些功能未知的蛋白质。其中, MdSCL8转录因子,由于其在草莓中的同源基因已被报导与黄酮的合成有关,引起了研究者的注意。进一步通过Y1H assay验证确认了MdSCL8可以与MdFLS1启动子互作(图2A)。通过双荧光素酶实验和GUS检测,发现MdSCL8可以负向调控MdFLS1...
酵母双杂交实验表明,PtMADS11 与 PtDAL1 之间存在直接的相互作用(图 C),并通过 BiFC、GST pull-down 得以证实(图 D-E)。为进一步研究在年龄信号调控中的作用机制,分别构建了过表达PtDAL1和PtMADS11的拟南芥。与对照相比,过表达PtDAL1***提前了拟南芥的营养-生殖时相转换(图A),证实PtDAL1在生殖起始和控制花***建立起到了关键作用。过表达PtMADS11植株在短日照下表现出早开花和花序结构过早终止,表明PtMADS11在开花调节和花序内分生组织命运起到调控作用。在拟南芥中利用年龄调控通路不同节点关键基因突变体进行功能互补实验,结果显示...
欧易生物酵母平台,从公司成立伊始,伴随着公司和客户一路成长,栉风沐雨十多年。不仅积累了沉甸甸的项目经验,获得了众多客户认可,协助客户发表Cell、Science 等前列期刊杂志。更值得骄傲的是,我们帮助了国内众多实验室,从无到有建立起了酵母杂交体系,对基础科研贡献了自己的一份力量。**值得欣喜的是,不断有人从我们的酵母产品用户成为了欧易大家庭的一员,流年笑掷,未来可期,我们一起携手继续做更走心的科研服务。欧易生物酵母平台,从公司成立伊始,伴随着公司和客户一路成长,栉风沐雨十多年。不仅积累了沉甸甸的项目经验,获得了众多客户认可,协助客户发表Cell、Science 等前列期刊杂志。更值得骄傲的是...
酵母单杂交筛选:(4)在筛选到的转录因子中,***GL1促进HIV-2转录。***GL1在免疫细胞中***表达,并与HIV的其他转录***因子,即Sp1、AP-1和PCAF/CBP/P300存在相互作用,本研究中显示HEK293T细胞中,***GL1过表达后,与LTR连接的萤火素酶表达上升近2倍,说明***GL1是一个转录***因子。值得一提的是,文章的背景介绍内容中,对应用其他技术(如RNAi、scRNA-seq、CRISPR等)对HIV转录调控方向的已有成果分析,发现这些方法为HIV-1的复制和潜伏期提供了见解,但并没有直接评估转录因子的结合和功能。文章中也对酵母单杂交技术与其他互作组技术...
通过传统的酵母双杂交系统,以PtDAL1为诱饵,筛选样本来源于不同年龄段的油松cDNA文库。将获得的阳性克隆,10个一组,挑选到1个96孔板的PCR板孔中,获得10*96个阳性克隆的96孔板。以其中阳性克隆mix为模板,进行PCR扩增,并将所有的PCR产物进行纯化。使用纯化后的PCR产物,进行打断后构建二代测序文库,通过NGS测序,获得6G的阳性克隆数据。通过分析二代测序数据,获得阳性克隆基因信息(去冗余后获得135个互作子,包含21个TFs,2个TRs及酶类、热激蛋白、RNA结合等蛋白,部分见表1)。挑选重要的候选基因进行一对一验证(图2)。与拟南芥中同源基因AGL6的蛋白互作网络进行比对分...
目前,欧易生物负责该水稻转录因子文库的维护和保存工作,并对广大水稻科研工作者提供转录因子筛选服务。如去年欧易生物助力中国科学院分子植物科学***创新中心的王二涛老师应用该文库对水稻-丛枝菌根进行了深入研究,成功构建了水稻-丛枝菌转录调控网络,结果发表于《Cell》封面。截至文章发表,该文库已收录了1683个水稻转录因子,隶属于54个家族,覆盖预测的水稻转录因子总量的70%。文库中水稻转录因子的a基因信息来源于PlantTFDB和KOME数据库。文库载体使用pGADT7,酵母菌株使用Y187,每一个转录因子菌株**保存于96孔板中。酵母文库双杂交技术及应用。北京宣传酵母文库做什么酵母单杂交筛选技...
酵母文库实验由欧易生物完成。2021 年 3 月,山东农业大学郝玉金教授为通讯作者,在 Plant Physiology 杂志(IF: 6.902)在线发表了题为“Interaction of BTB-TAZ protein MdBT2 and DELLA protein MdRGL3a regulates nitrate-mediated plant growth”的研究论文,深入探讨了硝酸盐介导的苹果生长调控分子机制。氮素是植物生长发育所必须的营养物质之一,硝酸盐是植物根系吸收无机氮的主要形式。除了营养功能,硝酸盐还可以通过多种信号途径来调节植物生长和发育过程。赤霉素(gibberelli...
酵母单杂交结果显示,磷酸盐饥饿响应因子OsPHR1/2/3可以***51个目标启动子中的25个,包括OsRAM1、OsRAD1、OsWRI5A等。OsRAM1、OsRAD1、OsWRI5A自身又可以调控许多菌根共生相关基因的表达(图A)。对丛枝菌根共生响应基因启动子序列预测分析显示,有78个转录因子被富集,87%的菌根共生响应基因受到OsPHR1/2/3的调控,其中42%受到OsPHR1/2/3的直接调控。因此推测OsPHR1/2/3可能是菌根共生调控网络中的一个关键调控枢纽(图A-B)。EMSA和荧光素酶报告实验证实,OsPHR12可以直接结合并***OsRAM1、OsWRI5A、OsPT1...
本研究利用水稻转录因子文库筛选,绘制了水稻转录因子和菌根共生相关基因之间的调控网络。该网络受到保守的磷感应途径统一控制,以磷酸盐饥饿响应因子(PHR)为中心。PHRs 是菌根共生所必需的,通过 P1BS 顺式作用元件调控菌根共生相关基因表达。高磷条件下,SPX蛋白抑制 OsPHR2 介导的对菌根共生相关基因表达的调控,进而抑制菌根共生。过表达 OsPHR2 可以部分拮抗磷介导的对菌根共生的抑制作用。本研究发现,植物直接营养吸收和通过菌根共生的间接营养吸收,都受到相同的磷信号网络统一调控。本研究将有助于高效用磷植株的培育。欧易生物提供的酵母杂交技术服务已经协助科研用户发表了Science、Cel...
酵母文库实验:本研究发现了一个硝酸盐响应的 BTB/TAZ 蛋白 MdBT2,它参与调节硝酸盐介导的苹果植株生长。利用酵母双杂交、蛋白质 pull-down、BiFC 实验证实,MdBT2 可以与一个 DELLA 蛋白 MdRGL3a 互作,这种互作是 MdRGL3a 蛋白经由 26S 蛋白酶体途径的泛素化及降解所必需的。此外,异源表达 MdBT2 部分回复了 MdRGL3a 过表达所导致的拟南芥生长抑制。综上表明,MdBT2 可以通过降低 DELLA 蛋白 MdRGL3a 的丰度促进硝酸盐介导的植物生长。实验室培养显示,培养 45 天,苹果幼苗的高度和生物量随硝酸盐浓度的增加而增加(图 A-...
欧易酵母文库助力小麦根研究,本研究克隆了小麦的 ERFs 转录因子家族 1 个成员 TaSRL1,它可以调控生长素生物合成、转运和信号转到相关基因的表达,并与生长素转运基因 TaPIN2 启动子序列结合促进其表达,进而抑制根的生长。此外,TaSRL1 可以与 JAZ 蛋白 TaTIFY9 相互作用,破坏 TaSRL1 对 TaPIN2 表达的促进作用。因此 TaSRL1 可整合根生长过程中生长素和 JA 信号,负调控根的伸长。TaSRL1-4A 标记对小麦育种过程中根系、株形和产量的改良具有重要研究意义。酵母文库构建方法酵母筛库构建酵母文库的意义。贵州酵母文库做什么酵母文库实验由欧易生物协助完...
酵母双杂交技术,自创建以来被广泛应用于蛋白互作研究领域,在生命科学的基础探秘研究中起着重要作用。然而该技术设计初衷,*是斯坦利先生为了完成申请学校经费的目的。该技术设计巧妙,它的许多优点在设计之初并未显现,反而在这么多年的高频使用和进一步开发利用过程中越发明显。(引用自MarcVidal&StanleyFields的“Theyeasttwo-hybridassay:stillfindingconnectionsafter25years”):(1)尽管酵母杂交技术揭示了蛋白质结合位点的详细信息,但操作简单。只需2个质粒+1个菌株即可完成,且有不同体系方便选择。(2)该技术利用比较好的DNA结合位...