精细诊断是精细医学的关键环节,液体活检作为一种无创、均一的检测技术,迅速成为精细诊断领域的新星,2015年被《麻省理工大学科技评论》评选为年度 突破技术,2017年入选世界经济论坛评出的全球 新兴技术,引发了全球科研、临床和产业界的极大热情,已在**、产前诊断、***移植等疾病领域***被应用。数字PCR技术与高通量的二代测序技术,共同组成液体活检领域的两大利器;数字PCR技术是公认的液体活检领域灵敏度比较高的检测方法,采用有限稀释的方法将目标分子分割到 的反应体系中,在不依赖标准曲线条件下实现靶标***定量检测,能检测低至0.01%的突变基因;Bio-Rad及ThermoFisher目前是这一领域的主导者,分别采用微滴或芯片方式将样本分割成两万份,MiniDrop?创新性采用高压驱动的方法将样本分割成50万份,打破了国外厂商在微滴式数字PCR领域的垄断。检测数量一次可达96个样品。南京微流控芯片数字PCR如何选型
数字PCR检测及分析原理在上世纪90年代就被提出来了,但是无奈受限于当时的技术条件,样本稀释及分配都是靠手工来完成的,受到很多因素的干扰和限制;并且结果分析对于研究者来说也十分枯燥与繁琐,因此在很长一段时间dPCR发展停滞不前。后来由于微流控技术与微纳集成制造工艺的发展解决了dPCR过程中的几个关键技术问题,推动了dPCR的研究与商业化的发展。目前根据dPCR样本稀释分配的方式,基本可分为三大类,一种是基于大规模集成微流控芯片;第二种是使用微反应室/孔板;第三种是微滴式。但不论是走芯片式还是微滴式,其基本原理都是将大量稀释后的核酸溶液分散至芯片的微反应器或者微滴当中,每个反应器的核酸模板数少于1或者等于1。经过PCR扩增之后,有一个核酸分子的模板的反应器就会给出荧光信号,没有模板的反应器没有荧光信号。根据相对比例和反应器的体积,可以推算出原始溶液的核酸浓度。无锡永诺数字PCR销售电话FAM、VIC双通道荧光检测。
MicroDrop-100数字PCR系统具有如下优点:1、JUE对定量,结果判读不需要依赖标准曲线;2、突破局限,检测灵敏度可低至万分之一;3、专利设计的具有高精度复杂三维微纳防污染结构的微流控芯片,单张可同时处理1-8个样本;4、一键式自动操作,20uLPCR体系可生成100,000微滴,8个样本单次微滴生成 需2分钟;5、FAM、HEX(VIC)双荧光通道,半导体激光器做为激发光源相比LED光源,稳定性高,功率稳定不影响检测灵敏度,单色性能优异降低对检测特异性的影响,且方向性好;6、检测器为2个光电倍增管,灵敏度及增益优于MPCC或CCD,普通的硅光子计数器,增益为10^5,光电倍增管增益可以达 到10^9;7、 知识产权的软件系统可直接计算拷贝数、拷贝数浓度,CNV值,突变丰度;阈值线可自动或手动完成,每个样本可单独设定阈值线;输出数据图标、直方图、一维图、二维图、浓度图、95%置信度不确定性区间等;软件可自动识别复杂微滴分簇四簇;软件具备数据质控功能,支持阳性微滴数、阴性微滴数、总微滴数统计及这些指标的任意组合;单个样本100,000微滴的反应体系以及高灵敏度的检测系统,配以独特的软件系统,可以实现高达20重的PCR分析;8、单次检测通量96个样本,操作灵活;
二代测序辅助建库目前靶向测序建库方法包括扩增子方法,在均相溶液中,当扩增引物增加时,由于扩增引物之间的相互作用,从而影响扩增的效率;如果将其分散到大量微液滴中扩增,将可降低引物间相互作用,提高扩增效率。同时还可以实现对于少量模板的有效扩增,得到更多的有效测序数据。CRISPR-Cas9基因编辑结果验证CRISPR-Cas9技术的发明,是基因编辑技术的一大突破,但如何验证实验是否成功,仍需要高灵敏度的检测方法,数字PCR技术可以满足这一需求。Broad研究所张锋团队发明了以CRISPR为基础的SHERLOCK技术可以对核酸进行高灵敏度的定性检测,但精确定量评估时仍采取了数字PCR进行确认。液体活检:早筛、用药、监测、复发。
数字PCR的应用检验检疫食品安全?转基因食品检测(国标)?病原菌鉴定?动物源性检测分析科研?基因表达差异监测?CRISPR-Cas9基因编辑结果验证?甲基化含量鉴定?单细胞研究:测序、PCR临床?**液体活检:早筛、用药、监测、复发?无创产前筛查:低成本、快速?***性疾病:HBV、HIV定量据悉,MiniDrop?**团队由微流控、光学、机电学、化学、临床医学、分子生物学等多学科交叉领域的**组成,依托精密仪器研发、生物纳米材料与分子生物学等平台,以微滴式数字PCR仪为**,打造了全自动液体处理工作站、核酸提取试剂盒等创新产品,致力于解决**、***领域的精细诊断。适用复杂样品的检测。南京微滴式数字PCR品牌
准确度不完全依赖于扩增效率。南京微流控芯片数字PCR如何选型
与常规PCR方法相比,数字PCR有如下优势:1、能够完全定量:常规PCR定量需要制定已知拷贝数的标准DNA曲线,但是由于待检样本与标准曲线不在统一体系,条件上会存在差异,另外加上PCR扩增效率的差异从而影响定量结果的准确性。而数字PCR不受标准曲线和扩增动力学影响,可进行完全定量。2、样本需求量低:适用于珍贵样本或核酸降解严重的样本3、灵敏度高:数字PCR是将传统PCR反应体系分割成数万个 PCR反应,这些反应可以精确地检测很小的目的片段差异、单拷贝甚至低浓度的混杂样本。且能避免非同源异质双链的形成。4、高耐受性:由于目的序列被分配到多个 反应体系中,明显降低了背景信号和yìzhì物对反应的干扰,扩增基质效应大大减小。南京微流控芯片数字PCR如何选型
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