首要部分是前期分析部分，包括对实验方案的设计、测序方案的设计、以及测序数据的质控。第二部分则是主要分析，包括转录组测序整体评估，基因差异表达分析及功能分析。第三部分是高级分析，这部分需要针对特定的实验目的和需求进行选择，如转录因子的分析、融合基因分析、与其他组学的联合分析等。转录组测序的根本目的在于回答特定的生物学问题，因此一个良好的实验方案的设计是其根本。其中，生物学重复的数量、文库类型及测序深度等因素直接关系到结果的好坏。在这里要尤其强调至少三个以上的生物学重复的重要性。三个以上的生物学重复是进行任何可信的下游数据的统计分析的基础，过少的生物学重复或者没有重复将使分析结果的可信度较大降低。（融享生物是提供转录组测序，宏基因组，16SITS等扩增子服务商之一。河南医学转录组测序公司哪家好

转录组成为研究基因表达的主要手段，转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带，转录水平的调控是目前研究较多的，也是生物体较重要的调控方式。对于真核生物来说，基因组比较大，测一个全基因组比较难，但是测转录组还是比较容易实现的。转录组测序转录组测序(Transcriptome sequencing)是通过二代测序平台快速多面地获得某一物种特定细胞或组织在某一状态下的几乎所有的转录本及基因序列，可以用于研究基因表达量、基因功能、结构、可变剪接和新转录本预测等。目前，转录组测序已经被广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。河南医学转录组测序公司哪家好转录服务博士团队专门为您打造属于您的服务。

转录组文库质量评估合格的转录组文库是转录组测序的必要条件，为确保文库的质量，要从以下三方面对转录组测序文库进行质量评估:通过检验插入片段在基因上的分布，评估mRN段化的随机性、mRNA的降解情况;通过插入片段的长度分布，评估插入片段长度的离散程度;通过绘制饱和度图，评估文库容量和MappedData是否充足。插入片段长度检验插入片段长度检验用于反映文库制备过程中磁珠纯化的效果。通过插入片段两端的Reads在参考基因组上的比对起止点之间的距离计算插入片段长度。大部分的真核生物基因为断裂基因，外显子被内含子隔断，而转录组测序得到的是无内含子的成熟mRNA。当mRNA中跨内含子的片段两端的Reads比对到基因组上时，比对起止点之间的距离要大于插入片段长度。因此，在插入片段长度模拟分布图中，主峰右侧有时会形成1个或多个小峰，此现象属于正常。

    本申请涉及转录组基因测序领域，特别是涉及一种转录组建库的方法、试剂和应用。背景技术：：基因组和转录组测序是生命科学领域的基础性工作。由于绝大部分非模式生物缺乏基因组数据，全长转录组测序就变得尤为重要，全长转录本可以促进这些物种的基因功能、基因表达调控和进化关系等多方面的基础与应用研究。当前，绝大多数的转录组数据都是基于第二代高通量测序技术获得的。然而，第二代测序技术测序序列短，短序列拼接无法提供大量的长转录本并且丢失了可变剪接等重要信息，因而转录组的从头测序开始采用pacbio第三代测序技术。在2013年pacbiorsii推出时，其通量较低，测序成本一直让科研人员望而止步。到2015年10月，pacbio推出sequel平台，大幅提升了全长转录组的测序通量，在通量上是pacbiorsii的5-10倍。鉴于三代测序技术在科研甚至临床领域的发展潜力，很多公司相继引入sequel平台，提供pacbio三代测序的全长转录组测序服务。目前pacbio三代测序的全长转录组按照pacbio公司推出的标准方案来进行，过程如图1所示，主要包括两个方面：cdna的制备和转录组建库。其中，cdna的制备包括使用clontech公司的smarterpcrcdnasynthesiskit试剂盒，将rna反转录生成cdna。融享生物在线为您提供众多企业转录组测序/mRNA测序技术服务。

如何获取mRN段？真核生物成熟的mRNA一般带有polyA尾巴，因此常规的转录组建库流程中通常直接对具有PolyA尾巴的片段进行捕获，这样可以得到纯度较高的mRNA。但是这样的方式对于mRNA的完整度要求较高，发生降解的样本使用这种建库方式会损失一定的转录组信息。另一种获得mRNA的方式则去除在TotalRNA中占比比较高的rRNA（通常占比超过90%以上），而剩下的RNA中就包括了mRNA（占比为1-2%），这种方式对降解样本的耐受度相对较高，但需要更高的测序数据量，且成本也更高。原核生物由于其mRNA不具有PolyA尾巴，因此只能选择rRNA去除的方式。转录组测序，提供更精确的数字化信号，更高的检测通量以及更多的检测范围。河南医学转录组测序公司哪家好

上海全转录组测序找融享生物科技有限公司。河南医学转录组测序公司哪家好

全转录组测序 通过全转录组测序可快速的获取某一条件下组织或细胞中大部分转录本的表达情况。与常规转录组测序相比，全转录组测序可以同时获得mRNA、lncRNA和circRNA三种类型的RNA信息。 欧易特色 丰富的建库经验，过硬的建库质量 10余年文库构建技术沉淀，具备处理复杂样品的能力和丰富的建库经验 具有特色的高级分析 lncRNA调控机制预测，lncRNA和mRNA的共表达分析，lncRNA、mRNA和circRNA的联合分析等 结合客户的需求，灵活进行定制化信息分析 推荐测序模式 Hiseq4000，PE150  一般测序：10 Gb/样本 深度测序：20 Gb/样本 案例展示 案例一  鉴别肺结核中circRNA的表达特征及构建ceRNA调控网络 研究背景 肺结核（PTB）是由结核杆菌引起的慢性疾病，对人类健康构成严重威胁。circRNA被认为在许多疾病的发病机理和发展过程中具有潜在的调控作用，然而，PTB中circRNA的表达模式和调控机理仍有待于研究。 技术路线   ceRNA调控网络 研究内容 欧易生物携手苏州大学生物与基础医学学院，通过全转录组测序探究肺结核中circRNA的表达特征。作者阐明了肺结核中circRNA的表达特征，通过GO和KEGG富集分析对circRNA进行了功能富集分析，构建了肺结核中circRNA的ceRNA调控网络。  河南医学转录组测序公司哪家好